U Sektoru za finansijsko - računovodstvene poslove obavljaju se zadaci koji se odnose na: finansijsko upravljanje i kontrolu, izradu periodičnih izvještaja i završnog računa za Direkciju, praćenje realizacije budžeta, izradu prijedloga zahtjeva koji služe za izradu dokumenta okvirnog budžeta (DOB) Direkcije i nacrta i prijedloga budžeta Direkcije, priprema i izrada mjesečnih, tromjesečnih i godišnjih planova, izradu izvještaja, informacija i drugih akata na temelju Budžeta, plana i programa Direkcije, praćenje i primjena propisa iz oblasti računovodstva, knjigovodstva i finansija, koji se odnose na finansijsko poslovanje Direkcije, pripremu, raspoređivanje i evidentiranje obaveza i potraživanja, evidencija ulaznih i izlaznih računa kroz glavnu knjigu Trezora, praćenje stanja raspoloživih sredstava, vođenje materijalnog knjigovodstva i knjigovodstva robnih rezervi i osnovnih sredstava Direkcije, kontrolu i manipulaciju uskladištenih roba i sirovina, provođenje redovnog i vanrednog popisa roba, praćenje toka nabavki i realizacije ugovora sa stanovišta finansijskog poslovanja, blagajnički poslovi Direkcije.